Os resíduos orgânicos constituem a maior parte dos resíduos produzidos pela população, com um potencial de valorização elevado, tanto na produção de energia como de corretivos orgânicos que podem ser utilizados na agricultura.
Estes resíduos já são recolhidos seletivamente em várias áreas do país, tendo sido esta recolha iniciada em Lisboa em 2005, com a implementação do Programa Mais Valor, iniciado pela Valorsul - concessionária da EGF para a região de Lisboa (Norte).
Para tratar os resíduos orgânicos, a EGF tem a funcionar em Portugal 16 centrais de valorização orgânica, que variam entre centrais de tratamento mecânico e biológico, centrais de compostagem e centrais de digestão anaeróbia.
As instalações de tratamento mecânico e biológico permitem separar embalagens e contaminantes provenientes da recolha de lixo comum e as centrais de valorização orgânica também separam as embalagens e contaminantes que possam estar nos biorresíduos, garantindo o envio das embalagens para reciclagem; a produção de corretivos orgânicos para a agricultura; e a produção de energia, nos casos em que existe a digestão anaeróbia dos resíduos.